他在关键时刻点拨明宣宗，直接救了皇叔朱高煦一脉

《明史·朱高燧传》记载：

宣宗擒高煦归，至单桥，尚书陈山迎驾，言曰：“赵王与高煦共谋逆久矣，宜移兵彰德，擒赵王。”帝未决。时惟杨士奇以为不可。

按理说，朱高煦造反，朱高燧身为藩王，只要按兵不动，就已经是不站在朝廷的立场上了，可以视为“谋反”。朱高燧此时命悬一线，他知道自己的处境不妙，每天把全家人的脑袋别在裤腰带上，随时准备被侄子明宣宗砍头问罪。众位大臣都顺势而为，纷纷上书建议捉拿朱高燧，将朱高燧问罪处斩。就连老谋深算的杨荣(也是“三杨”之一)，也支持捉拿朱高燧。为何杨士奇却反对呢?

杨士奇的理由是：“太宗仅三子!”

杨士奇对明宣宗表达的意思是：你爷爷朱棣(太宗皇帝)只有三个儿子，如今先帝(朱高炽)已经驾崩，朱高煦已经伏法，只剩一个朱高燧了。朱高燧反形未显，你将他治罪，会伤了先帝和太宗的心。如果你饶了朱高燧，他必定感恩戴德，从此再也不反。

明宣宗朱瞻基读懂了杨士奇的意思，他不仅没有将皇叔朱高燧治罪，反而将大臣的奏折给朱高燧看，并好言安慰朱高燧。朱高燧非常感动，他是聪明人，立即把自己的护卫献给朝廷，手里不再拥有任何兵权。从此之后，明朝历史上，赵王朱高燧一脉，都非常安分。

杨士奇身为“三杨”之首，学识渊博，深谙人心。这样的结局，是双赢。